Ярославский «Шинник» принимал участие во всех розыгрышах Кубка России по футболу. Лучший результат — выход в полуфинал (2004, 2018).

Розыгрыши Кубка России по футболу проводятся с осени 1992 года. Первый финальный матч состоялся 13 июня 1993 года в Москве на стадионе «Лужники». Ранее, с 1936 по 1992 год (с перерывом с 1941 по 1943), разыгрывался Кубок СССР по футболу. В этом турнире «Шинник» выступал с момента создания команды — с 1957 года.

Всего в розыгрышах Кубка России «Шинник» провёл 62 матча (ещё два матча ¼ финала не состоялись в связи с тем, что в начале 2005 года волгоградский «Ротор» снялся с соревнований). В 30 встречах «Шинник» одержал победы (в трёх из них — в серии пенальти), одна завершилась вничью, в 31 матче ярославцы проиграли (дважды — по пенальти).

Один раз «Шинник» начинал турнир с 1/128 финала (и сразу вылетел), один — с 1/64 (вылетел), четырнадцать раз — с 1/32 (дважды вылетел), девять раз — с 1/16 (трижды вылетел).

Всего в 1/16 финала «Шинник» играл 21 раз (провёл 25 матчей), в девяти розыгрышах прошёл в 1/8 финала (11 матчей), четыре раза играл в четвертьфиналах (6 матчей, 2 победы), дважды выходил в полуфинал (2004 и 2018).

В четырёх кубковых турнирах (с 12-го по 15-й) на стадиях с 1/16 по ½ финала проводились парные матчи.

Все матчи «Шинника» в розыгрышах Кубка России по футболу:

1-й розыгрыш Кубка России. 1992/1993.

1/16 финала. 7 октября 1992. «Текстильщик» (Иваново) — «Шинник» — 1:2 (0:2).
1200 зрителей. Голы: 0:1 — Гладышев, 15, 0:2 — Яшкин, 31, 1:2 — Тихонов, 78.

1/8 финала. 14 ноября 1992. ЦСКА — «Шинник» — 5:1 (3:1).
2000 зрителей. Голы: 0:1 — Гладышев, 21, 1:1 — Корсаков, 25, 2:1 — Файзулин, 37, 3:1 — А. Гришин, 41-пен., 4:1 — Колесников, 64, 5:1 — Иванов, 66.

2-й розыгрыш Кубка России. 1993/1994.

1/128 финала. 18 апреля 1993. «Вымпел» (Рыбинск) — «Шинник» — 2:2 (пен. — 5:3).
5000 зрителей. Голы: 1:0 — Ленивков, 15, 1:1 — Гладышев, 82, 2:1 — Фатахетдинов, 92, 2:2 — Помазов, 112.

3-й розыгрыш Кубка России. 1994/1995.

1/32 финала. 26 августа 1994. «Торпедо» (Таганрог) — «Шинник» — 0:2 (0:2).
4000 зрителей. Голы: Яблочкин, 8, Иляскин, 40.

1/16 финала. 5 октября 1994. «Шинник» — «Текстильщик» (Камышин) — 0:3 (0:0).
1500 зрителей. Голы: Цыганков, 53, Наталушко, 58, Новоченко, 85.

4-й розыгрыш Кубка России. 1995/1996.

1/64 финала. 15 мая 1995. «Текстильщик» (Иваново) — «Шинник» — 3:0 (1:0).
4000 зрителей. Голы: Загоскин, 44, Тувин, 56, Зернов, 76.

5-й розыгрыш Кубка России. 1996/1997.

1/32 финала. 30 июня 1996. «Динамо» (Брянск) — «Шинник» — 2:3 (2:3).
4000 зрителей. Голы: 0:1 — Бычков, 11, 0:2 — Яблочкин, 16, 0:3 — Иляскин, 36-пен., 1:3 — Усиков, 44, 2:3 — Усиков, 45.

1/16 финала. 6 ноября 1996. «Шинник» — «Динамо» (Москва) — 1:3 (1:1).
13 000 зрителей. Голы: 0:1 — Черышев, 24, 1:1 — Яшкин, 44-пен., 1:2 — Штанюк, 72, 1:3 — Кобелев, 81.

6-й розыгрыш Кубка России. 1997/1998.

1/32 финала. 6 июля 1997. «Динамо» (Вологда) — «Шинник» — 0:1 (0:0).
6000 зрителей. Гол: Леонченко, 72.

1/16 финала. 13 августа 1997. «Шинник» — «Зенит» (Санкт-Петербург) — 2:3 (1:1).
10 500 зрителей. Голы: 0:1 — Лепехин, 2, 1:1 — Филиппов, 45, 2:1 — Енин, 51, 2:2 — Вернидуб, 73-пен., 2:3 — Попович, 81.

7-й розыгрыш Кубка России. 1998/1999.

1/16 финала. 12 сентября 1998. «Чкаловец (Новосибирск) — «Шинник» — 0:0 (пенальти — 2:4). 15 000 зрителей.

1/8 финала. 6 ноября 1998. «Шинник» — «Носта» (Новотроицк) — 2:1 (0:0, 1:1, 1:0).
1900 зрителей. Голы: 1:0 — Серебренников, 50, 1:1 — Филиппов, 80, 2:1 — Бычков, 104.

¼ финала. 7 апреля 1999. ЦСКА — «Шинник» — 1:0 (1:0).
2000 зрителей. Гол: Варламов, 31.

8-й розыгрыш Кубка России. 1999/2000.

1/16 финала. 12 октября 1999. «Сокол» (Саратов) — «Шинник» — 1:0 (0:0).
13 000 зрителей. Гол: Грицына, 86.

9-й розыгрыш Кубка России. 2000/2001.

1/32 финала. 16 июля 2000. «Спартак» (Луховицы, Московская обл.) — «Шинник» — 0:2 (0:0). Голы: Бакалец, 49, Зацепин, 81.

1/16 финала. 10 сентября 2000. «Шинник» — ЦСКА — 1:6 (1:3).
12 000 зрителей. Голы: 0:1 — Кулик, 13, 0:2 — Кулик, 23, 0:3 — Кулик, 33, 1:3 — Новгородов, 38-пен., 1:4 — Бычков, 62, 1:5 — Савельев, 65, 1:6 — Корнаухов, 69.

10-й розыгрыш Кубка России. 2001/2002.

1/32 финала. 30 июня 2001. «Мосэнерго» (Москва) — «Шинник» — 2:3 (0:2).
1000 зрителей. Голы: 0:1 — Карпенко, 35, 0:2 — Новгородов, 43-пен., 1:2 — Афанасьев, 52, 1:3 — Бакалец, 55, 2:3 — Самородов, 90.

1/16 финала. 21 августа 2001. «Шинник» — «Спартак» (Москва) — 1:0 (0:0).
24 000 зрителей. Гол: Скоков, 79.

1/8 финала. 16 октября 2001. «Сатурн» (Раменское, Московская обл.) — «Шинник» — 0:0 (пенальти — 5:4). 8000 зрителей.

11-й розыгрыш Кубка России. 2002/2003.

1/16 финала. 14 сентября 2002. «Металлург» (Липецк) — «Шинник» — 2:1 (1:1).
15 000 зрителей. Голы: 0:1 — Васильев, 12, 1:1 — Вековищев, 25, 2:1 — Петухов, 62.

12-й розыгрыш Кубка России. 2003/2004.

1/16 финала. 1-й матч. 14 октября 2003. «Арсенал» (Тула) — «Шинник» — 0:2 (0:2).
15 000 зрителей. Голы: Хазов, 11, 44.

1/16 финала. 2-й матч. 9 ноября 2003. «Шинник» — «Арсенал» (Тула) — 3:4 (2:2).
1500 зрителей. Голы: 0:1 — Надейкин, 17, 0:2 — Коровушкин, 27, 1:2 — Берко, 29, 2:2 — Кухар, 35, 3:2 — Берко, 54, 3:3 — Климов, 67, 4:3 — Даев, 77 — в свои ворота.

1/8 финала. 1-й матч. 7 марта 2004. «Алания» (Владикавказ) — «Шинник» — 1:0 (0:0).
25 000 зрителей. Гол: Бараса, 82.

1/8 финала. 2-й матч. 24 марта 2004. «Шинник» — «Алания» (Владикавказ) — 3:0 (1:0).
10 000 зрителей. Голы: Ширко, 85, Васильев, 108, Желсон, 120.

¼ финала. 1-й матч. 14 апреля 2004. «Шинник» — «Локомотив» (Москва) — 3:0 (2:0).
8000 зрителей. Голы: Луценко, 28-пен., Карпенко, 45+, Хазов, 88.

¼ финала. 2-й матч. 14 апреля 2004. «Локомотив» (Москва) — «Шинник» — 4:1 (1:0).
7200 зрителей. Голы: 1:0 — Лоськов, 42-пен., 2:0 — Хохлов, 53, 3:0 — Гуренко, 56, 3:1 — Ширко, 57, 4:1 — Сычев, 72.

½ финала. 1-й матч. 5 мая 2004. «Терек (Грозный) — «Шинник» — 0:0. Пятигорск.
6000 зрителей.

½ финала. 2-й матч. 12 мая 2004. «Шинник» — «Терек (Грозный) — 1:2 (1:1).
7000 зрителей. Голы: 0:1 — Джабраилов, 3, 1:1 — Гришин, 43, 1:2 — Федьков, 62.

13-й розыгрыш Кубка России. 2004/2005.

1/16 финала. 1-й матч. 31 июля 2004. СКА (Хабаровск) — «Шинник» — 3:0 (2:0).
12 000 зрителей. Голы: Пятенко, 3, Живновицкий, 38, Удо, 90-пен.

1/16 финала. 2-й матч. 10 августа 2004. «Шинник» — СКА (Хабаровск) — 4:0 (1:0).
2000 зрителей. Голы: Ширко, 19, Кушев, 58, 75-пен., Лагиевка, 84.

1/8 финала. «Шинник» — «Ротор» (Волгоград).
Матчи, назначенные на 9 и 16 марта 2005 года, не состоялись
в связи со снятием «Ротора» с соревнований по финансовым причинам.
«Шинник» вышел в следующую стадию Кубка России.

¼ финала. 1-й матч. 7 апреля 2005. «Зенит» (С.-Петербург) — «Шинник» — 4:0 (3:0).
19 000 зрителей. Голы: Аршавин, 11, Радимов, 15, Горшков, 25, Аршавин, 78.

¼ финала. 2-й матч. 20 апреля 2005. «Шинник» — «Зенит» (С.-Петербург) — 1:4 (1:2).
2500 зрителей. Голы: 0:1 — Гартиг, 8, 1:1 — Погребняк, 12, 1:2 — Шумуликоски, 30, 1:3 — Трифонов, 52, 1:4 — Гартиг, 65. На 75 минуте Малетич («Шинник») не реализовал пенальти.

14-й розыгрыш Кубка России. 2005/2006.

1/16 финала. 1-й матч. 6 июля 2005. «Металлург» (Липецк) — «Шинник» — 1:0 (0:0).
5000 зрителей. Гол: Жуковский, 52.

1/16 финала. 2-й матч. 13 июля 2005. «Шинник» — «Металлург» (Липецк) — 4:0 (3:0).
2500 зрителей. Голы: Васильев-мл., 18, Хазов, 28, Балтиев, 30-пен., Фролов, 47 — в свои ворота. На 60 минуте Балтиев не реализовал пенальти.

1/8 финала. 1-й матч. 5 марта 2006. «Шинник» — «Рубин» (Казань) — 1:0 (1:0).
Москва, стадион «Лужники», запасное поле. 500 зрителей. Гол: Хазов, 27.

1/8 финала. 2-й матч. 8 марта 2006. «Рубин» (Казань) — «Шинник» — 2:0 (0:0, 1:0, 1:0).
Москва, стадион «Лужники», запасное поле. Голы: Бикмаев, 83, Базаев, 109.

15-й розыгрыш Кубка России. 2006/2007.

1/16 финала. 1-й матч. 2 июля 2006. «Динамо» (Брянск) — «Шинник» — 2:0 (2:0).
6500 зрителей. Голы: Сантос, 4, 39.

1/16 финала. 2-й матч. 20 сентября 2006. «Шинник» — «Динамо» (Брянск) — 3:1 (1:1).
1000 зрителей. Голы: 0:1 — Були, 11, 1:1 — Бакош, 15-пен., 2:1 — Костич, 48, 3:1 — Бакош, 88.

16-й розыгрыш Кубка России. 2007/2008.

1/32 финала. 13 июня 2007. «Шинник» — «Текстильщик» (Иваново) — 1:1 (пенальти — 4:2). 8000 зрителей. Голы: 0:1 — Коротков, 33, 1:1 — Скворцов, 90. На 112-й минуте Вахлаков («Текстильщик») не реализовал пенальти (вратарь).

1/16 финала. 27 июня 2007. «Шинник» — «Спартак» (Нальчик) — 1:2 (0:0, 0:0, 1:2).
13 000 зрителей. Голы: 1:0 — Хазов, 93, 1:1 — Шумейко, 101, 1:2 — Балкаров, 119.

17-й розыгрыш Кубка России. 2008/2009.

1/16 финала. 27 июня 2008. «Салют» (Белгород) — «Шинник» — 0:1 (0:0).
10 000 зрителей. Гол: Кудряшов, 69.

1/8 финала. 24 сентября 2008. «Шинник» — «Спартак» (Москва) — 1:2 (0:1).
6000 зрителей. Голы: 0:1 — Рыжков, 45, 0:2 — Прудников, 50, 1:2 — Кудряшов, 57.

18-й розыгрыш Кубка России. 2009/2010.

1/32 финала. 1 июля 2009. «Торпедо» (Владимир) — «Шинник» — 1:0 (0:0).
10 000 зрителей. Гол: Втюрин, 71.

19-й розыгрыш Кубка России. 2010/2011.

1/32 финала. 1 июля 2010. «Торпедо» (Владимир) — «Шинник» — 1:3 (0:0).
7100 зрителей. Голы: 0:1 — Монарев, 61, 0:2 — Корытько, 75, 1:2 — Вязьмикин, 78-пен., 1:3 — Рыжков, 89.

1/16 финала. 13 июля 2010. «Шинник» — «Крылья Советов» (Самара) — 2:1 (1:1).
4200 зрителей. Голы: 0:1 — Дрмич, 39, 1:1 — Вьештица, 41-пен., 2:1 — Говоров, 81.

1/8 финала. 28 февраля 2011. ЦСКА — «Шинник» — 1:0 (1:0).
6000 зрителей. Гол: Игнашевич, 23.

20-й розыгрыш Кубка России. 2011/2012.

1/32 финала. 4 июля 2011. «Шинник» — «Балтика» (Калининград) — 2:1 (1:0).
3500 зрителей. Голы: 1:0 — Корытько, 3, 1:1 — Голубов, 56, 2:1 — Саркисов, 84.

1/16 финала. 17 июля 2011. «Шинник» — «Волга» (Нижний Новгород) — 0:1 (0:0).
4800 зрителей. Гол: Салуквадзе, 69.

21-й розыгрыш Кубка России. 2012/2013.

1/32 финала. 2 сентября 2012. «Волга» (Ульяновск) — «Шинник» — 2:1 (1:1).
Голы: 1:0 — Вагапов, 34, 1:1 — Стешин, 41, 2:1 — Барсов, 70-пен.

22-й розыгрыш Кубка России. 2013/2014.

1/32 финала. 1 сентября 2013. «Химки» (Московская обл.) — «Шинник» — 1:2 (0:0).
500 зрителей. Голы: 1:0 — Решетников, 64, 1:1 — Горбатенко, 72, 1:2 — Малоян, 88.

1/16 финала. 30 октября 2013. «Шинник» — «Спартак» (Москва) — 0:1 (0:0).
17 500 зрителей. Гол: Дм. Комбаров, 70-пен.

23-й розыгрыш Кубка России. 2014/2015.

1/32 финала. 30 августа 2014. «Текстильщик» (Иваново) — «Шинник» — 0:1 (0:0).
8200 зрителей. Гол: Войдель, 119.

1/16 финала. 25 сентября 2014. «Шинник» — «Динамо» (Москва) — 2:0 (0:0).
9500 зрителей. Голы: Самодин, 68, 75.

1/8 финала. 29 октября 2014. «Мордовия» (Саранск) — «Шинник» — 5:1 (0:0).
2800 зрителей. На 30 мин. Горбатенко («Шинник») не реализовал пенальти (перекладина). Голы: 1:0 — Сысуев, 52, 2:0 — Луценко, 54, 3:0 — Власов, 65, 4:0 — Васин, 67, 5:0 — Мухаметшин, 72, 5:1 — Рылов, 86-пен.

24-й розыгрыш Кубка России. 2015/2016.

1/32 финала. 11 сентября 2015. «Шахтёр» (Пешелань, Нижегородская обл.) — «Шинник» — 2:3 (1:1, 1:1, 0:1). Дзержинск, Нижегородская обл.
600 зрителей. Голы: 0:1 — Мязин, 11, 1:1 — Заболотный, 31, 2:1 — Заболотный, 49, 2:2 — Мязин, 72-пен., 2:3 — Айрапетян, 119. На 87-й мин. Мязин не реализовал пенальти (мимо).

1/16 финала. 23 сентября 2015. «Шинник» — «Кубань» (Краснодар) — 1:2 (0:0).
4100 зрителей. Голы: 0:1 — Нурисов, 50, 0:2 — Волчков, 85, 1:2 — Платика, 90.

25-й розыгрыш Кубка России. 2016/2017.

1/32 финала. 24 августа 2016. ЦРФСО (Смоленск) — «Шинник» — 0:1 (0:0).
2000 зрителей. Гол: Подоляк, 90.

1/16 финала. 21 сентября 2016. «Шинник» — «Крылья Советов» (Самара) — 0:2 (0:1).
1200 зрителей. Голы: Корниленко, 32, Ткачёв, 56.

26-й розыгрыш Кубка России. 2017/2018.

1/32 финала. 23 августа 2017. «Химки» (Московская обл.) — «Шинник» — 0:2 (0:0).
1130 зрителей. Голы: Лях, 29, Самойлов, 87.

1/16 финала. 20 сентября 2017. «Шинник» — «Урал» (Екатеринбург) — 3:0 (2:0). Кострома, пос. Караваево. Стадион «Урожай».
1500 зрителей. Голы: Фатихов, 8, Безлихотных, 44, Крамаренко, 56.

1/8 финала. 25 октября 2017. «Шинник» — «Олимпиец» (Н. Новгород) — 4:0 (2:0). Кострома, пос. Караваево. Стадион «Урожай».
500 зрителей. Голы: Чистяков, 20, Крамаренко, 24, Лях, 47, Кагермазов, 70-пен.

¼ финала. 28 февраля 2018. СКА (Хабаровск) — «Шинник» — 0:0 (пенальти — 1:4).
2405 зрителей. Пенальти: Безлихотнов — 0:1, Самсонов — 1:1, Низамутдинов — 1:2, Калинский — 1:2 (штанга), Шайморданов — 1:3, Маркович — 1:3 (мимо), Камилов — 1:4.

½ финала. 18 апреля 2018. «Авангард» (Курск) — «Шинник» — 1:0 (0:0).
10 500 зрителей. Гол: Киреев, 79.

27-й розыгрыш Кубка России. 2018/2019.

1/32 финала. 22 августа 2018. «Торпедо» (Москва) — «Шинник» — 2:0 (1:0).
Москва. Стадион им. Э.Стрельцова. 13 422 зрителя. Голы: Кертанов, 22, Сергеев, 82.

28-й розыгрыш Кубка России. 2019/2020.

1/32 финала. 21 августа 2019. «Шинник» — «Текстильщик» (Иваново) — 1:0 (1:0).
Ярославль, стадион «Шинник». 3 000 зрителей. Гол: Низамутдинов, 33.

1/16 финала. 25 сентября 2019. «Шинник» — «Сочи» — 0:0 (пенальти — 5:4).
Ярославль, стадион «Шинник». 2850 зрителей. Пенальти: Заболотный — 0:1, Низамутдинов — 1:1, Миладинович — 1:2, Визнович — 1:2 (вратарь), Лагатор — 1:2 (мимо), Щербаков — 2:2, Мостовой — 2:3, Кожемякин — 3:3, Бурмистров — 3:4, Пухов — 4:4, Полоз — 4:4 (вратарь), Олейников — 5:4.

1/8 финала. 30 октября 2019. «Нижний Новгород» — «Шинник» — 2:2 (пенальти — 0:3).
Нижний Новгород, стадион «Нижний Новгород». 8114 зрителей. Голы: 0:1 — Самойлов (32), 0:2 — Эктов (35), 1:2 — Хозин (61), 2:2 — Хозин (90). Пенальти: Хозин — 0:0 (вратарь), Олейников — 0:1, Палиенко — 0:1 (вратарь), Самодин — 0:2, Чудин — 0:2 (вратарь), Кожемякин — 0:3.

В ¼ финала соперником «Шинника» стал «Урал» (Екатеринбург), обыгравший 30 октября по пенальти (5:4) тульскую команду «Арсенал» (в основное время — 2:2). Первоначально матч был назначен на 4 марта 2020 года в Ярославле, однако он не состоялся в связи с неудовлетворительным состоянием поля стадиона «Шинник». Встреча была перенесена на 18 марта и должна была пройти на стадионе «Химки» в городе Химки (Московская область). Но в связи с начавшейся эпидемией коронавируса матч был отложен на неопределённый срок.
15 мая решением РФС матч «Шинник» — «Урал» был назначен на 24 июня 2020 года. 19 июня РФС утвердил местом его проведения стадион «Шинник» в Ярославле.

¼ финала. 24 июня 2020. «Шинник» — «Урал» (Екатеринбург) — 0:2 (0:1).
Ярославль, стадион «Шинник». Без зрителей (в связи с запретом массовых мероприятий в период пандемии коронавируса). Голы: Бабин (16), Августыняк (80).

29-й розыгрыш Кубка России. 2020/2021.

1/64 финала. 26 августа 2020. «Торпедо» (Москва) — «Шинник» — 1:2 (0:2).
Москва. Лужники. Спортивный городок. Голы: 0:1 — Кутин, 9, 0:2 — Самодин — 44, 1:2 — Адаев, 79.

Групповой раунд (1/32 и 1/16 финала)

1 октября 2020. «Знамя» (Ногинск, Московская обл.) — «Шинник». 25 сентября у нескольких игроков «Шинника» был зафиксирован положительный тест на коронавирус. В связи с этим команда была отправлена на двухнедельный карантин. Кубковый матч «Знамя» — «Шинник» отменён, ярославской команде засчитано техническое поражение — 0:3.

21 октября 2020. «Шинник» — «Ахмат» (Грозный) — 1:1 (пенальти — 3:4).
Ярославль. Стадион «Шинник». Голы: 0:1 — Альсултанов, 54, 1:1 — Евсеев 90+3. Пенальти: 0:1 — Харин, 1:1 — Пухов, 1:1 — Анхель (вратарь), 2:1 — Бетюжнов, 2:2 — Швец, 2:2 — Голуб (перекладина), 2:3 — Альсултанов, 3:3 — Масленников, 3:4 — Кармаев, 3:4 — Зинков (перекладина).

30-й розыгрыш Кубка России. 2021/2022.

1/128 финала. 28 июля 2021. «Волна» (Ковернино, Нижегородская обл.) — «Шинник» — 0:0 (пенальти — 5:4).
Нижний Новгород. Стадион «Локомотив».
Пенальти: 1:0 — Стрелов, 1:1 — Зинков, 1:1 — Ручнов (вратарь), 1:1 — Хитяев (вратарь), 2:1 — Козловский, 2:2 — Гонгапшев, 3:2 — Пальцев, 3:3 — Кожухарь, 4:3 — Таликин, 4:4 — Щадин, 5:4 — Кабаев, 5:4 — Канаев (мимо).